Segunda-feira, 24 de junho de 2013. - Cientistas da Austrália e dos Estados Unidos fornecem novos conhecimentos para a compreensão da estrutura tridimensional do genoma, um dos maiores desafios atualmente enfrentados no campo da genômica e genética, cujas conclusões são publicadas em sua edição digital ' Nature Genetics '.
Cerca de três metros de DNA estão estreitamente dobrados no núcleo de cada célula do nosso corpo, o que permite que alguns genes "expressem" ou se ativem, excluindo outros. Os médicos Tim Mercer e John Mattick, do Garvan Institute for Medical Research, em Sydney, e o professor John Stamatoyannopoulos, da Universidade de Washington, em Seattle, analisaram a estrutura 3D do genoma em alta resolução.
Os genes são compostos de "éxons" e "íntrons", o primeiro sendo as seqüências que codificam e expressam as proteínas e o último trechos de DNA não codificador no meio. À medida que os genes são copiados ou transcritos, a partir do DNA no RNA, as seqüências de íntrons são cortadas ou "unidas" e os exons restantes são encadeados para formar uma sequência que codifica uma proteína. Dependendo dos exons que são espetados, o mesmo gene pode gerar proteínas diferentes.
Através do uso de grandes quantidades de dados do projeto ENCODE, o Dr. Tim Mercer e seus colegas deduziram o dobramento do genoma, descobrindo que, mesmo dentro de um gene, os exons selecionados são facilmente expostos. "Imagine uma videira longa e imensamente complicada, com seus galhos retorcidos que apresentam algumas uvas que podem ser facilmente arrancadas, enquanto escondem outras além de seu alcance", ele dá o exemplo. Mercer
"Ao mesmo tempo, imagine um apanhador de frutas preguiçoso apenas colhendo as uvas na ponta dos dedos - ele acrescenta -. O mesmo princípio se aplica ao genoma. Genes específicos e até exons específicos são colocados ao alcance de dobrar". Nesse sentido, esse pesquisador ressalta que, nos últimos anos, os cientistas começaram a avaliar como o dobramento do genoma ajuda a determinar como ele é expresso e regulado.
"Este estudo fornece a primeira indicação de que a estrutura tridimensional do genoma pode influenciar a divisão de genes. Podemos inferir que o genoma se dobra de tal maneira que a região promotora, a sequência que inicia a transcrição de um gene, é encontrado próximo aos exons e todos são levados para o maquinário de transcrição ", enfatiza.
"Isso apóia uma nova maneira de ver as coisas, que o genoma curva ao redor da maquinaria de transcrição, e não o contrário. Esses genes que entram em contato com a maquinaria de transcrição obtêm cópias, enquanto as partes que orbitam longe eles são ignorados ", conclui esse pesquisador.
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Cerca de três metros de DNA estão estreitamente dobrados no núcleo de cada célula do nosso corpo, o que permite que alguns genes "expressem" ou se ativem, excluindo outros. Os médicos Tim Mercer e John Mattick, do Garvan Institute for Medical Research, em Sydney, e o professor John Stamatoyannopoulos, da Universidade de Washington, em Seattle, analisaram a estrutura 3D do genoma em alta resolução.
Os genes são compostos de "éxons" e "íntrons", o primeiro sendo as seqüências que codificam e expressam as proteínas e o último trechos de DNA não codificador no meio. À medida que os genes são copiados ou transcritos, a partir do DNA no RNA, as seqüências de íntrons são cortadas ou "unidas" e os exons restantes são encadeados para formar uma sequência que codifica uma proteína. Dependendo dos exons que são espetados, o mesmo gene pode gerar proteínas diferentes.
Através do uso de grandes quantidades de dados do projeto ENCODE, o Dr. Tim Mercer e seus colegas deduziram o dobramento do genoma, descobrindo que, mesmo dentro de um gene, os exons selecionados são facilmente expostos. "Imagine uma videira longa e imensamente complicada, com seus galhos retorcidos que apresentam algumas uvas que podem ser facilmente arrancadas, enquanto escondem outras além de seu alcance", ele dá o exemplo. Mercer
"Ao mesmo tempo, imagine um apanhador de frutas preguiçoso apenas colhendo as uvas na ponta dos dedos - ele acrescenta -. O mesmo princípio se aplica ao genoma. Genes específicos e até exons específicos são colocados ao alcance de dobrar". Nesse sentido, esse pesquisador ressalta que, nos últimos anos, os cientistas começaram a avaliar como o dobramento do genoma ajuda a determinar como ele é expresso e regulado.
"Este estudo fornece a primeira indicação de que a estrutura tridimensional do genoma pode influenciar a divisão de genes. Podemos inferir que o genoma se dobra de tal maneira que a região promotora, a sequência que inicia a transcrição de um gene, é encontrado próximo aos exons e todos são levados para o maquinário de transcrição ", enfatiza.
"Isso apóia uma nova maneira de ver as coisas, que o genoma curva ao redor da maquinaria de transcrição, e não o contrário. Esses genes que entram em contato com a maquinaria de transcrição obtêm cópias, enquanto as partes que orbitam longe eles são ignorados ", conclui esse pesquisador.
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